Há doze anos, uma raposa demónio de nove caudas atacou a aldeia ninja de Konohagakure. O líder da aldeia da altura (Hokage), derrotou-a e selou o seu espírito no interior do corpo de Uzumaki Naruto, uma criança recém-nascida.

Naruto é hoje um jovem ninja em formação, com queda para a traquinice, que leva muito a sério a missão de vir a ser o maior ninja do mundo e tornar-se o Hokage da aldeia Oculta da Folha.

Na fase inicial da formação para se tornar ninja, Naruto faz equipa com Uchiha Sasuke e Haruno Sakura, sendo treinados por Kakashi, um ninja de elite.

• Uzumaki Naruto
Um jovem ninja em formação, que passa o tempo a arreliar os companheiros, mas tem o sonho de ser um dia Hokage da sua aldeia.

• Uchiha Sasuke
O melhor aluno da turma de Naruto, membro do clã Uchiha.

• Haruno Sakura
Colega de Naruto e Sasuke, por quem Naruto tem um fraquinho.

Parte I: volume 1 a 27
A primeira parte da história que acompanha a formação de Naruto, treinado por Kakashi e depois por Jiraiya.

Parte II: volume 28 a 78
A ação inicia-se quando Naruto retorna à sua aldeia, dois anos e meio de treino, depois de deixar os seus colegas de célula.